mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCATCCAGGGAGCCAGACAGA GTTCATGGTTGAACGGTGGGGAGTTGGACTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACCTGCGGGGCTTGTCAAAATGATTGCCAGGCTGCATAGCTGGCATCCAGGGAGCCAGACAGACCTTTCTCTTGCCTCATCCGGGTCCC 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 3e-30 ppt-MIR160a 9e-33 -68.7 .....(((.(((..((..((..(..((.(((.(((((((((((.((((((.(((.(.((((((.(((.....))).)))))).).))).)))))).))))))))))).))).))..)..))..))))).)))...... (-68.70)