mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCTTGTATGCCA CCATGCAGGGAGTCAGACAGA CTCATGAAATCAATGGGGAATATTGGACCTGCCTGGCTCCTTGTATGCCATCTGCGAAGCTTGACAAAACTATTGCCAGGGTACATAGCTGCCATGCAGGGAGTCAGACAGACCGTACGTCTTCCCAGATTTACATGC 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 0.000000000000002 ppt-MIR160e 1e-19 -52.1 ..(((((((((..((((((....(((..(((.(((((((((((((((.((.(((.(.(.((((.(((.....))).)))).).).))).)).))))))))))))))).))).)))......))))))))))).)))). (-52.10)