mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTGGCTCCTTGTATGCCA GCACTCAGGGAGTCAAGCAGG TTAGTTCAGCATGGGGAGATATCGGATCCGCCTGGCTCCTTGTATGCCAACTGAGAAGCTTGTTGAACATTTTGCCAGGATTCATAGCTGGCACTCAGGGAGTCAAGCAGGCCATTGGTCTTGCCATGACTTTCAC 4 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 0.000000008 ppt-MIR160i 0.0000000001 -53.7 .......(((((((.(((((...((.((.((.((((((((((..(((((.(((.(((.((((..((.....))..)))).))).))).)))))..)))))))))).)).))))....))))).))))).))..... (-53.70)