mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTTCAGGGAGTCAAGCAGGC CGTTAGCACGGAATATGGGATACTGGATCCGCCTGGCTCCCTGTATGCCACCTGCGAAGCATGCTAAAGGTTTTTGCCAGGATTTGCAGCTGGCGTTCAGGGAGTCAAGCAGGCCTCAAGTCTTCCCGTAACCAGCGCC 2 1 5' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-160 2e-43 ppt-MIR160b 0.000000000002 -59.8 .....((.(((..(((((((.(((.((.((((.((((((((((.((((((.(((((((.....((...(((....))).)).))))))).)))))).)))))))))).)).))..)).)))..))))))).)).).)). (-59.80)