mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCCGTCTGGACCGGAG ACTTGGTGCAACATGGGACTTTATCGTGGGGAATGCCGTCTGGACCGGAGCTGTGTGTCCACTCTGCATCAAAGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCGAGGGAGTTTCATAGCAGTGCTAT 3 0 3' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-166 1e-38 ppt-MIR166d 0.0000000004 -61.9 ...(((..(..((((..((((..(((.((((((((..((((((.((((((((.(((((.......))).)).)))))))).))))))..)))))))).)))..))))..))).)..)..))). (-61.90)