mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAATAAGATGAATGGTCAA GACTGTTCGTTTTATTCAAAA GAACTCCAGATGATACATGATACACCCTCCTTTCCTAAATGTTTGACGCCGTGAACTTTTTTAAACATGTTTGACTGTTCGTTTTATTCAAAAATTTTTGTGAAATATGTAAAACTATATGCATACATTATATGTATACATTAAAGTATATTTAACAATTAATCAAATTGTAGGAAAATAATTAATAATTACTTAAACTTTTTGAATAAGATGAATGGTCAAACATGTTTAAAATGGTCAATGGCGTCAAATATTTGGGGATGGAGAGAATATATTCGTTAATTGCTCCTC GCACGAGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGAACAAATCATGCATGCATATAGCACTAGAACTCCAGATGATACATGATACACCCTCCTTTCCTAAATGTTTGACGCCGTGAACTTTTTTAAACATGTTTGACTGTTCGTTTTATTCAAAAATTTTTGTGAAATATGTAAAACTATATGCATACATTATATGTATACATTAAAGTATATTTAACAATTAATCAAATTGTAGGAAAATAATTAATAATTACTTAAACTTTTTGAATAAGATGAATGGTCAAACATGTTTAAAATGGTCAATGGCGTCAAATATTTGGGGATGGAGAGAATATATTCGTTAATTGCTCCTCATGCGTGCATATACACTACTACTCCCGATGACGCACACACACAGAGATATATAATAACCCTCCCTTAATAAGTAATTAATATAGGAGTAATTGTTCAATTCGAGTTAAACATATATGTACCTTAAGCCAATTATTTCCCCGAGTAAGAGGATACACATGTACATTCATATGTATATATCATTTCCCTCCGACTAAAATATAACAAGTTACTGTAGGATGTATGCAGTCCGCTATC 0 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 2e-137 osa-MIR806h 8e-29 -94.1 ........(((((......(((....((((.(((((((((((((((((((((..(((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((..((((((....)))))).((((((...))))))..(((((..(((.(((.((((((.....))))))..))).))).)))))..))))..))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))..))))))))))))))))))))).))))....)))..)))))........... (-94.1)