mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCCCCCTGGCCCGAAG GTGCGGAGGTGTTTAGGTGAAACTCTGCTGCGAGGAATGCCCCCTGGCCCGAAGGCATGTACTTCTCCCTCTTCGAATGGTGTGAGCATCAAGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGCGCAGTTACATTTCGATATTCACGTC 5 0 3' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-166 1e-47 ppt-MIR166e 0.000000000008 -54.2 ..(((..((((((.(((((.((((.(((((.(.((((((...(((((.((((((.(.((...(((.(((.........)).).)))...)).))))))).)))))...)))))).).))))).)))).))))).))))))..))). (-54.20)