mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGACGAGTGGCCCAGA AGTTCGACAAGACTATGAGACTTTGTCATGAGGAATGACGAGTGGCCCAGATTCGTTTCTGGTCTAGAAATTGAATTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTTGGCACGGTTCCATGGAGGTACTGTCA 5 1 3' arm Physcomitrella_patens mirbase mir-166 4e-38 vvi-MIR166g 0.0000004 -45.5 .....((((..((((((..(((.(((((.(.(((((((.(..(((((.(((((((((((((...)))))).))))))).)).)))..).))))))).).))))).)))..)))...)))..)))). (-45.50)