mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTCCCTCAAAGGCTTCCA GAAGCCTTTGTGGGAGAGGA GTTGCTTTTTCCTCTCCCTCAAAGGCTTCCAACATGATGTGCGTAAGCCACAACGTTAGAAGCCTTTGTGGGAGAGGAAGAAACA 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR473 7e-42 ppt-MIR477a 4e-43 -47.2 ..((.(((((((((((((.((((((((((.(((.((.((.((....))))))..))).)))))))))).))))))))))))).)) (-47.20)