mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTCCCTCAAAGGCTTCCA GAAGCCTCTGGGGGTGACGA GTTGATTTCGATTAAACAGATTGCTTGTTCCTCTCCCTCAAAGGCTTCCAACAACAGGTACTTGGTCTTGTTTTCACCAGCAAAGCTAAGGCCCGTCCCAGATGTTAGAAGCCTCTGGGGGTGACGAAGCAGCAGCTGTATGGGTGGTTCCCAT 4 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR473 4e-60 ppt-MIR477a 0.000000002 -57.8 ((((....))))...((((.(((((..(((.((.((((((.(((((((.((((((.(((.(((((..(((((......)))))..)))))))).))......)))).))))))).)))))).)).)))..))))))))).((((.....)))). (-57.80)