mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCAAAGGCTTCCAACAA GTCGGAAGCCTTCGAGGGAGA GTGTTTGTTTTTCTCCCTCAAAGGCTTCCAACAACAGGAGGGTACAATTCCATTGTGGTTATAACCCATAGTTGAGGTGTTTTTGCTCTCTCTGCTGTCGGAAGCCTTCGAGGGAGATGAAAGAATT 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR477 1e-66 ppt-MIR477g 0.000000000007 -58.7 ..((((.(((.((((((((.(((((((((.(((.((((((((((((.(((.(((((((.......))))))).))).)))....)))))).))).))).))))))))).)))))))).))).)))). (-58.70)