mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCAAAGGCTTCCAACAA GTTGGAAGCCTTCGTGGGAGA GTGTTCGTTTTTCTCCCTCAAAGGCTTCCAACAACAGTCGGAATTAACTCTGATGCGGCCATTATCACTGGTTGCAGTGAATTATTCTAGTTCTGCTGTTGGAAGCCTTCGTGGGAGACGAAAGAACC 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR477 2e-67 ppt-MIR477g 1e-68 -58.3 ..((((.(((.((((((.(.(((((((((((((.(((..(((((.((.((...((((((((.......))))))))..)).)))))))....))).))))))))))))).).)))))).))).)))). (-58.30)