mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAAGAGAGAGAGCACAGCCC GCTGTGCTCTCTCTTTTCCAG TTCAGCCGTACTACACCCAAGCCGGGATTCGAAGAGAGAGAGCACAGCCCGTAACTTTCACTAAAGACCACTTATTGTGGTTCATTGGAGATTTGATGTCGGGCTGTGCTCTCTCTTTTCCAGTCCCTACTCGGATGTGTCGCCATCAC 1 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR529c 9e-24 -71.2 ....(.((.((.(((.((.((..((((((.(((((((((((((((((((((((.(..((.((((.((((((.....))))))..)))).))...).)).))))))))))))))))))))).))))))..)).)).))))))).)..... (-71.20)