mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGAGAGAGAGTACAGCCC GCTGTGCTCTCTCTCTTCTTG TGCACAATTTTCTCACTCATGCTGGGATCAGAAGAGAGAGAGTACAGCCCAACGGCCGATGTTCAGTTGGAACGGGCTGTGCTCTCTCTCTTCTTGTTCCAACCTGGGTGCATTTCCGTTCT 0 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR529e 1e-28 -62 .............((((((.(.((((((.(((((((((((((((((((((.....(((((.....)))))...))))))))))))))))))))).)))))).).))))))............ (-62.00)