mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAAGAGAGAGAGCACAGTCC GCTGTACTCTCTCTTTTCCAG TCACCTTTTTCTACATTCAAGCTGGGGTTCGAAGAGAGAGAGCACAGTCCCAGACTTTTCACTCACGACCACTTTGAGTGTCTTATGGTGAACAGTAGTCGGGCTGTACTCTCTCTTTTCCAGTCCCTACTCGAATGTGTTTCTATCGC 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR529b 0.0000000000005 -59.4 ...........(((((((.((..(((..(.((((((((((((.(((((((...(((.((((((...(((.((.....)))))....)))))).)))....))))))).)))))))))))).)..)))..)).))))))).......... (-59.40)