mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTCCATTGCAGTTGCATAC ATGCAACTTGTGTGGACAGACT ATATGCATGCAACTTGTGTGGACAGACTGACTAGTCTAGTGGTGTAGTGGAAAGTATTAGTTGGTTGATGCACGATGTTGTTTTGCAACAAGTGACTCGTCGCTGCAATACTGAACCCACAAGTTTTGGAAGTTGTTTTGATTGGGGCCACCCACATTGCTCGACTAGATTCAGTATGTCCATTGCAGTTGCATACATAT 5 0 3' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR534b 0.00000004 -75.32 (((((.((((((((...(((((((.(((((((((((.((..((((.((((..((((((.((.(((.(((((((..(((((.....))))).)))...)))))))))))))))...((((((((.............))))..)))).))))..))))..)).))))))..))))).)))))))...)))))))).))))) (-75.32)