mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAAGGTCTGCATCATAGC TATGATGCAGATTCTTCACCT GCTCGTGACCCTCTGAAGGGAACTTTGGCCTGAGAAGAGCGTGGGATTGTAGGAACATGAGTGGATCTACAGCATTTGAGATTATTCATTTGCATCCGCTACGATATGATGCAGATTCTTCACCTGTGTGATACTCTTGAGGTATAACAGACGAAGGTCTGCATCATAGCCAAGCGAACGTAAATCTGGTGCATTCAACACTAGATGCTTAATTGAGGTGCAT 4 1 3' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR902a 5e-125 -71.8 ((..((..((((....)))).))....((((.((..((((.......((((((..((....))..))))))(((..((((....))))..)))...((((....((((((((((((.((((..((((...(((((.....))))).))))..))))))))))))))))....)))).......((((((((.......))))))))))))..)).)))))).. (-71.80)