mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAAGGTCTGCATCATAGC TATGATGCAGATTCTTCATCT GGTTGTGATAAATCGGTTCCGTGTCGTCATAATCGCAAGTGTTGCAGGCAGTTATGAGGAGATGGAGAGCGTGCAGACTTGTTTCCTTCCTCTAGCCTATGATGCAGATTCTTCATCTGTTTGTTATCGTTCTCATGGTGTACATAACAGACGAAGGTCTGCATCATAGCCAAGAGGAAGCAAATCTTAATACCTGGCTCGAATTTGGCCTGCACGCAATTTT 2 1 3' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR902b 5e-125 -90.2 ((((......))))..((((((.((.(((((((.((..(.....)..)).))))))).)).)))))).((((((......((((.((((((((.(.(((((((((((((.((((.(((((((((((((((....)))))).))).)))))).))))))))))))))))).).)))))))).))))..........((((.......)))).))))))...... (-90.20)