mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATGATGTAGATTCTTCAT GAAGGGTCTACATCATAAAC CCTGCACAACCCACAAAATCGTGTTGATCTAGATTATGATGTAGATTCTTCATCTGGAATTGAATTTCGATTTAAGAAGAAGGGTCTACATCATAAACTGGATGATTACGATTGTTGGATAACAGCAG 1 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR902h 1e-68 -55.9 .((((.....(((...(((((((.(.((((((.((((((((((((((((((.(((.((((((.....)))))).))).)))))))))))))))))).)))))).).)))))))..)))......)))) (-55.90)