mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATGTTGCAGATTCTTCATT AGAAGGATCTGCAACATAGAC GCGGGTTAAAGTTGAACAGGTTGCCTCTCTCGTATATGTTGCAGATTCTTCATTTGTCTAGCTGATCAACTATAGTATTGATTTGTCTAGCTGATCAACTATAGTATTGACTGTCATGCAAAAGAAGGATCTGCAACATAGACAAGAATAGGTGATCGATTTTTATACACTCA 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR902j 3e-95 -60.82 ..((((.......(((..(((..(((.(((.((.(((((((((((((((((.(((((.(..(.(.(((((((((((..(((((.(.....).)))))))))))))..)))).)..).))))).))))))))))))))))).)).)))..)))..)))..)))......)))). (-60.82)