mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTGTCAATGTTTAGGGGCA CCCCTAAATCTTGGCAAGACC TGTTGGAGTTCCTTCGGTGTGGTGTTGCAATATTTGTGATGCTAATATGGTCTTGTCAATGTTTAGGGGCAAAGGCCTGATTATGCAGATGCTTGGTGTAAGCTTATGCTTGTACAACTTTTGCTATTGGCCTCCACCCCTAAATCTTGGCAAGACCTAATTAGCCCACAACATTGAATTGACCGGGACCGGCGACTAATCAGTACGAGCTCAAGCAGGA 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR904b 0.000000000000003 -86.6 ((((.((((((..(((((.(.(.(((.((((..(((((..((((((..(((((((((((.(((((((((...(((((.(((...(((((......((((((((....))))))))....))))).))))))))...))))))))).)))))))))))..)))))).))))).))))....)))).).)))))..(((....)))..)))))).))))... (-86.60)