mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACACTCTCTCCATTTCTCTAC AGAGAATTGGAGAGAGTGCAT GGGAGCGATTGGACCACCTTGCAGTTTCATGGCACACTCTCTCCATTTCTCTACCGTTCATGCAGCGGTTGATCGATTGGGTTGCTGGTTGATTGATCGATCGATGGTCAGGAGTTGGAAGAGAATTGGAGAGAGTGCATTGTGAATTGCGGGGTTGACGAGGCGGAGGG 3 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR1023 1e-91 ppt-MIR1023a 2e-93 -74.6 ....((..(((..(.(((((((((((.((..(..(((((((((((.((((((.((((((..((..((((((((((((..(.(....).)..))))))))))))...))..)))..))).)))))).)))))))))))..)..))))))))))))).).))).))...... (-74.60)