mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCACTCTCTCCGTTTCCCTTCC AAGGGAAATGGAGAGAGTGTAT TGTAGAAGATGCAGCTTGCAGATTATCATCCACTCTCTCCGTTTCCCTTCCCACAGCTATCATCCGGACTAGCATTTCCTGTACATACTAGGGAAGGGAAATGGAGAGAGTGTATAATGAATTGCATGCTTGATTGCTGAG 1 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR1023 5e-75 ppt-MIR1023c 0.0000004 -59.9 ..(((..(((..(((.(((((.((((.((.((((((((((((((((((((((...((((((.....)).)))).......((....))..)))))))))))))))))))))).)).)))).))))).)))..))).))).. (-59.90)