mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGGTTGGATTGTAGGCCTC CGCCTTGCAATTCAAGCAGACT GTAGACGCCTTGCAATTCAAGCAGACTCTATTATGCGGCTGCCGCGGACACTACGTGGTTTGTTGTGCTTCAGTCTGGTTGGATTGTAGGCCTCCGCAAAACTTCATGACCATCGCAACTACTG 2 1 3' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR1024a 0.000000000000007 -43.6 (..((.((((.(((((((((.((((((.......(((((.((((((.......))))))..))))).....)))))).))))))))))))).))..)........................... (-43.60)