mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTCTATCTTCTCTTCCAATC TTGGAAGAGCAGATCGAAAAA GTGCAAGAGCAGATACTTAAGTCGAAGAGCATCTTTCTATCTTCTCTTCCAATCTATTGATCTGCCCTTCCAATACTATCAGATCAATAGATTGGAAGAGCAGATCGAAAAATGCTCTCACCTTAAGGAGAGACAGCGACTC 2 0 5' arm Physcomitrella_patens mirbase MIR1027 1e-66 ppt-MIR1027a 7e-77 -59.06 .(((....)))....((((((..((.((((((.((((.((((.(((((((((((((((((((((...............))))))))))))))))))))).)))).)))).))))))))..))))))............... (-59.06)