mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGCATCTGCACCTGCACCA GTGCAGTGCTTATGCAGAAA AAGGTACGCAATTAAAGCTGCACCGTCACATTTCTGCATCTGCACCTGCACCAAAACGCGACTTTGAGGTTGTGATGGAATTCTGCAGTCACACCCAGCCATTTGCAAGAGTGTTCTGCCGGTGTTGGATTGTGGCAATGGATTGCATTCACAGGCTTGTGTACTGGTGCAGTGCTTATGCAGAAATGTTGCGTTGTAGCTCAAACTGGATTGAG 2 1 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR1030e 0.0000007 -88.9 ........(((((..(((((((.(((.((((((((((((..((((.(((((((..((((......(((.((((((((.(((((....((((((.(((((.((..(((.(......))))..)))))))..))))))...))))).)).)))))).)))))))..)))))))))))..)))))))))))).))).))))))).......))))).. (-88.90)