mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGCATCTGCACCTGCACCA GTGCAGTGCTTATGCAGAAG TGTCATGCATCTGCATCTGCACCTGCACCACAATGTGATCGCGGCGATCTCTGTTCCGGAGGTTCAGCCCGGTAGTTTTACATGCGGCCCTGCATTCAGCGCTGGCATCTTCCGTGGACAAGTTTCGTAGCTCACATTCCGATGGTGCAGTGCTTATGCAGAAGCGTTGC 2 1 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR1030c 0.00000003 -72.8 .((.((((.(((((((..((((.(((((((.(((((((..((.((((.((.(((((((((((....(((.(((.(((....(((((....)))))..)))))))))..)))))).)))))))..)))).)))))))))....)))))))))))..))))))).)))).)) (-72.80)