mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGCATCTGCACCTGCACCA GTGAGATGCAGATGCAGAGG AGTCCTCCGCTCTGCTGCAATGTAATGTGTCTGCATCTGCACCTGCACCACGGTGTAACAGTGGCGACGCTTTTTCTTGCGGATATCAGGCACTCATGCCGTTGCTTCCCTGCATTTTCCAATGTGGCGTTGGTGCAATCCGCAGACAATCAGTGTCTCTCACATTACGATGGTGAGATGCAGATGCAGAGGTGTTACATTGCAACTGACCCTCAATT 1 1 5' arm Physcomitrella_patens mirbase 100 ppt-MIR1030c 0.00000001 -90.5 ..........((.(.((((((((((..(.((((((((((((.((.(((((...(((((..((((.((((((((.(((.((((((.....(((((.((((((.(((......)))..........)))))).))))).))))))))).))..)))))).).))).))))).))))))).)))))))))))).)..)))))))))).).))......... (-90.50)