mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGTTAAGCTCAGGAGGGATA TCCATCCTGAGTTTCATGGCT TGTCTAAAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTCTCTCT ACGGCCGGGGAAGAACCAACCAAAACANNNNACTCAATTCCAAAGTCTTCTATCTAGTTTGGTTCGGTTTCTTGGTTTTTAGTTGTGAGAAAGCATTGTCTAAAAGTAAAGAAGAATCTGTTAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGGGTGCCATGAATATGGGAATGATCTAGGGTTTCATGATAAATAATGGGCACTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGCTTCTTCTTACTCTCTCTCTCGAGATCGGCTC 2 0 5' arm Citrus_sinensis mirnest MIR390 0.0000000000001 csi-MIR390 7e-77 -56.9 ........(((((.((((((.((((.((((((((((.((((((((((...((((((.....(((((((...........)))))))..........)))))))))))))))).)))))))))).)))).)))))))))))........ (-56.9)