mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTTGCACTTATTTTGGGACG TTTTTTAATAGATGACGCCGC CGGAAACTCATGGTTGCACTTATTTTGGGACGGAGGTAGTAAGTCATAAGTACATGATTTGAGTATTAATTTACTGTAAACTTAAAAATGAGTCTATTTGATTTCCTTACAAAGATTTTTGCATAGAAAATTTTTGTATGAAACGTACTCCCCTCCGTTTTTTAATAGATGACGCCGCTGATTTTT ATGGTTTTCAGCGCCCAACTTTGACCATTCTTCTTATTTGAAAATTTTTTGAAAAAAATTAAAAACATAAGTCACGAGTAAAGTACTATTCATGTTTTATCATCTTATAACAACAAAATTACTAAGTATAAAAAAATTTCAAATAAGACGGACGATCAAAGTTCGGCGCGGAAACTCATGGTTGCACTTATTTTGGGACGGAGGTAGTAAGTCATAAGTACATGATTTGAGTATTAATTTACTGTAAACTTAAAAATGAGTCTATTTGATTTCCTTACAAAGATTTTTGCATAGAAAATTTTTGTATGAAACGTACTCCCCTCCGTTTTTTAATAGATGACGCCGCTGATTTTTTTCCTCACATG 5 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 0.0000000000008 osa-MIR812a 0.000009 -44.3 ..((((.(((((((..((.(((((..((((((((((....(((((((......)))))))((((((..(((....(((.(((((....))))).)))..)))(((..(((((((((((((.....))))))))))))).)))..)))))).))))))))))..))))).))..)))).))).)))) (-44.3)