mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGACTTTCTAGCATTATCC ACNATACTAGAAAGTCTTATA AGGAGATTACTACTTCCTCCGTATCATATTATAAGACTTTCTAGCATTATCCATATTCATATATATGTTAATGAATCTAAACATATATGTGTCTATATTCATTAACATCTATATAAATATGGACNATACTAGAAAGTCTTATAATCTGAAACGGAGGTAGTAGAAAATAGA TTTCCCGACGCGTGGGCGGCGACAGGGTGGAGGTGAAGACGGTGAGGTACCCCATCTTCCTCAGGATCGGCAAGGTGAGGCCCGAGTAATAGGAGATGAGCCNGCCAACGGGGAGAAATTAAGCTTGATAGACTTGGGCGAACGTGCTTTGTCTAGCACACATTAGTGCATTACTCTGTTATCTTCAGAGGCGATCTGCANCTAGGAGATTACTACTTCCTCCGTATCATATTATAAGACTTTCTAGCATTATCCATATTCATATATATGTTAATGAATCTAAACATATATGTGTCTATATTCATTAACATCTATATAAATATGGACNATACTAGAAAGTCTTATAATCTGAAACGGAGGTAGTAGAAAATAGATGCGGCTTTNCCGCATAATGGACCNGCCAGTACGAAATACTCCATATGTTTCATATTGATCATCATTTAACNCCAATTAAAATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 2e-38 osa-MIR819b 4e-48 -74.7 .........(((((.(((((((.(((.(((((((((((((((((.((..((((((((.(((((.((((((((((((.((.((((....)))).)).)))))))))))).))))).))))))))..)).))))))))))))))))).))).))))))).)))))........ (-74.7)