mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGACTTTNTAGCATTGTCC GCAATGCCATAAAGTCTTACA ANATATGTAATAACCCCTCCGTTNCATATTATAAGACTTTNTAGCATTGTCCACATTTATATAGATGTGGGCAATGCCATAAAGTCTTACAATATGAAAACGGAGGAAGTCTTGTAACT ATTTCCCTTGGGAAANCAACCATTTTTCCCCCCTTAAGGGAATTGCTGAAAACATGTCGCAAGTTCTCGTAAAGAAAAACTTTTAAATNTCACTATGGTATAATTGTAATATAATTANATATGTAATAACCCCTCCGTTNCATATTATAAGACTTTNTAGCATTGTCCACATTTATATAGATGTGGGCAATGCCATAAAGTCTTACAATATGAAAACGGAGGAAGTCTTGTAACTACGGTACTGCATTCTTTTCAAATTACAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 3e-23 osa-MIR819a 0.000000000000002 -47.8 ...............((((((((.((((((.(((((((((...(((((((((((((((....)))))))))))))))...))))))))).))))))..))))))))............. (-47.8)