mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGGGAGCTCCC GAGCTCCCTTCAATTCAACTG TTGCAGGGGGAGCTCCCTTCAATTCAACTGAGGTCGGTGCGTCGCTGTTACTCGCTGCTGACTCATGCATTCGCCTGACATGCCCGCAACCATCATCAGATCGTGATCAGGACACGCCGAAAACATGCCCGTGATCACCTCCGCAACTCTCTGATCTCGGCGAGGTTGATCACAGAATCCCCCGAGTTTGAGGCATGGCAGCCGTGTGCATGATGCAGGAGCAGGTGCGGCTTCGGCTCTGAACTTCCCTTGGATTGAAGGGAGCTCCCTTCCAGATTC 1 0 3' arm Selaginella_moellendorffii mirbase 100 pta-MIR159c 0.000004 -123.64 (((..((((((((((((((((((((((..((((((((.(((..(((((.((..(((.(((..((((((((.((.(((.((((((..(((...((....((((((((((((..(.((((((............(((((..............))))))))))).).)))))))).).)))....))..))).)))))).))).)).))))))))..))).)))..)))))))..).)).))).)))))..)))))))))))))))))))))).))).... (-123.64)