mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTGTCAAGCTGTGTGCATC TGCACTCAGCTTGACACGGCC GTGTTTTTGATGCACTCAGCTTGACACGGCCGTGCTTGGAAGTCTGGAAAGTTTTCTTTCACGCTCCACTGATGCTGCTGCTGCAATGCGTGCTGACTCTCTCTCTCTCTCTTGGTCGTGTCAAGCTGTGTGCATCACAACGCATTGCTCGTTTTCA 1 0 3' arm Selaginella_moellendorffii mirbase 100 100 -63.6 (((((..((((((((.((((((((((((((((....((((.((...(((((....)))))..))))))...(((((((....)))..)))).....................)))))))))))))))).)))))))).))))).............. (-63.60)