mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG GGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAAGATCATTAGATTGATTCATCTTAAAGAATGAAAACCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACC 5 0 3' arm Arabidopsis_lyrata mirbase mir-166 6e-43 ath-MIR166d 2e-45 -41.9 (((((.(.((((((..((((((..(((((((((..((..((((....))))..((((((.....).)))))....))..)))).)))))..))))))..)))))).).))))) (-41.90)