mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCACGAGG GAGTCCATGTTCTTCAGTGAAGCTTTTTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTTAGATCTATATTTGATTTTATGTCTCTTCTTTATTTATTAGTCTATATATACATGAATGATCGATTTTAACGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAATTATATCGCTTCTTCGATCTTGGCTT 4 0 3' arm Arabidopsis_lyrata mirbase mir-166 1e-42 ath-MIR166e 1e-42 -57.76 (((.(((.(....((...(((((........((((((((((((..((((((..(((.(.(.((((((.(((((.......(((.....)))......((((((((..((........))))))))))..)))))....)))))).).).)))..))))))..)))))))))))).......)))))...)).).)))))) (-57.76)