mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTCCTTCGGCTACA GTGCCCAACGGAGTAGAATTGCATGAAGTGGAGTAGAGTATAATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAACGTTGTTAATCATACGTATAAATTATGTGATGAACATATTTCTGGCAAGTTGTCCTTCGGCTACATTTTGCTCTCTTCTTCTCATGCAAACTCTCTTTGGGATAT 3 1 5' arm Arabidopsis_lyrata mirbase MIR169_2 5e-26 ath-MIR169b 6e-56 -80.9 ...(((((.((((.((..((((((((...((((.((((((.((((.(((((((((..(((((((((((...((((.(((..(((((.....)))))))).))))...)))))))))))..))))).)))).)))).))))))))))...)))))))).))))))))))).... (-80.90)