mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCATCTCTGGCTATG GTCTCATCTAAAGCCTTGAATGTGGGAAAAAGGCCATTGTTGTTCAGCCAAGGATGACTTGCCGGTAGCTTTGTATATTTACTCTATATTCGGTTTATATTATGGAGATTATGCTTTATATATATATATACATAGTTTTAATTGATTTTTTTTCGTACGTACGTAATCTAATACGAAAAAGTATTTACTTATTTATATGTGTGTTGGTGAGATGTGTAAACAAAGCAAGCCCGGCAAGTCATCTCTGGCTATGCAACTGCCTCTTCCTCTCATTCTAGGCTTACGATGACAC 3 0 5' arm Arabidopsis_lyrata mirbase MIR169_2 4e-22 ath-MIR169c 4e-40 -106.94 ((.(((((..((((((.(((((.(((((..((((....(((((..(((((..(((((((((((((..(((((((.......(((((((............)))))))..(((((.((.(((....(((((((((....(((.(((..((((((((((..............))))))))))...))).)))....)))))))))..))).)).))))).)))))))....)))))))))))))..)))))..))))).)))).)))))..))))).))))))..))))).)) (-106.94)