mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTCTCTCTTCTGTCAAAT GGCATGGATGGATGGCCA CATATGGTTGGTGGCATGGATGGATGGCCAGTGACAAGTGTCTCCAAGCAGGTATCTGGAAATCAAACCACTGTCACAGCAAGGCATCTTCCTCAGCCACTATGGCAAAACCACTCTCAGGATCCTCCACCTGATCGTTACCTTCAGTGTTCAACAGCTGGGACTGGTTTCTCTGGTCCTGGAATTCCTTGTGGAGGATGCTTCACAGGAGTTGCTGAACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAACCATGG CCCACGTCCGGAGACAGCAGCCAAGGTGGACCATTTATGATCGACTTCAGTGCATATCATATGGTTGGTGGCATGGATGGATGGCCAGTGACAAGTGTCTCCAAGCAGGTATCTGGAAATCAAACCACTGTCACAGCAAGGCATCTTCCTCAGCCACTATGGCAAAACCACTCTCAGGATCCTCCACCTGATCGTTACCTTCAGTGTTCAACAGCTGGGACTGGTTTCTCTGGTCCTGGAATTCCTTGTGGAGGATGCTTCACAGGAGTTGCTGAACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAACCATGGGGCTCTAACAAACAGACACCGGGTCATGGAGTGGGTGAATTAATGCATGCCACAATCAATATCCGTCACTCAACCAATATACCCTCGTGGAGCAACTATTAATCGATATCCAAAAGAATCATGGGGGTTTACAGGGTAATGCAGACTGGTAACCTCTTCAACCAAATAGGCCCACAGACTGGGTTTGAGTCCAACATCCGAGGACATAAAACGATCATATATAAGGAGAGAATGAAACAGACAAAAAAAAGAAAGAAAAACAAGAAAAATTCAAAATTCATAGAGAATAAAAATAATCACCACAGTCTGTATCCTTGGTTCCCCCTAGATAGTCCGGTATAGCATACATCAATGATAGAACAAAAACCTCCCCGGATCTATATAACGACTCATGAGACTGTACAAAATTTATTACAAAAAGAAAGGCAAATACCACAATTCAGTAAAAAATTAGGAAACAACAACCACACACAAAAAAGAAATCAGCACAATAAAAAAAAATAAGAAAGAAAAACAAAAGAAAAAAAGAACAAAATGAAAAATACCAAACACCAATCATAAATCAACACACTTAAAAAAAGTAAATCATAGAAATAAAAGACATGGTAG 5 1 3' arm Citrus_sinensis mirnest mir-156 0.001 far-MIR529 0.0000002 -71.4 ..((((((((((((((.(((.(((.(((..((((((.(((..((((..........))))........)))))))))....(((((((((((...((((...))))......((....((((...((((...(((((..(((.(((((........)))))....))).....))))).))))..)))).))))))))))))).(((((((((....)))))...))))))).))).)))..)))))..))))))))). (-71.4)