mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCTTCATCATCATCATCA GTATGTGACGGTTGAGATGTAT CAACCTTCACGCTCCAATGAGCTTCAGAAGTTCCACCATTATGGCATCAGTTTGCATAATATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATCATTCATTTTTATCAGGTTATATTCATGAATAAGCAATGATGGTTTTATAGCCATTTATACAAGTACTGGTCAAAGGTATTCATTCTAATAGATATAACCCAATCAAAAGACAAGTGATAGACCCGACACAAAAATTCAATAATCAAGTGATCCCAAAAATTTTATAGCAAAGTACATAAAAGTTGATGATGACTGATGGGCTTTACAGTCGAAGCCTGGTATATCCATTAATCAGGATTCTTCATGAGTCTAGTGGTAAGATTCGATGGTGATGGTATGGTATGTGACGGTTGAGATGTATAGTGACAGGCATAACCGAAAGGGATCTTCGTGAGGCCAAGTTAGTAAGAGAATCAGAG GTCACTTCATAATATCACGAAATGCAGGGTTCTGACACTTCACTGAGTCAGCTAGGTGTTTACTATTAGTAACAAAGAATACTAGTAATATCAGCCATCCGTGTCACATGTCACATGAAGGGCACTTGCTCCTCCTCCTCTCCATGTGATGCTACCTTCGACTCAACCTTCACGCTCCAATGAGCTTCAGAAGTTCCACCATTATGGCATCAGTTTGCATAATATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATCATTCATTTTTATCAGGTTATATTCATGAATAAGCAATGATGGTTTTATAGCCATTTATACAAGTACTGGTCAAAGGTATTCATTCTAATAGATATAACCCAATCAAAAGACAAGTGATAGACCCGACACAAAAATTCAATAATCAAGTGATCCCAAAAATTTTATAGCAAAGTACATAAAAGTTGATGATGACTGATGGGCTTTACAGTCGAAGCCTGGTATATCCATTAATCAGGATTCTTCATGAGTCTAGTGGTAAGATTCGATGGTGATGGTATGGTATGTGACGGTTGAGATGTATAGTGACAGGCATAACCGAAAGGGATCTTCGTGAGGCCAAGTTAGTAAGAGAATCAGAGCCGTTTAGCTCTTTGGGCTCCATGGGTCAAGCC 4 1 5' arm Persea_americana mirnest 100 100 -88.4 ..........(((..(((..((((((((((.(((....((.(((.....((((((((.(((.((((((.(((.((((.(((((((((((((((...((((((((..(((.(((((((((.((....((((((...((((.((..((((..........(((...(((..(((((((....(((........)))...)))...))))...))).)))...........))))(((.((.(((.(((...((((((..........)))))).)))..))).))))).(((((((......))))))))))))).)))))).......)).))))))))).)))))))))))...)))))))))))..))))..)))).))).))))))))).))).)))))....))).)).))).)))).))))))...))))))..((...)).... (-88.4)