mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCTTCCTCTTCCTCTTCCT GATGAGGATGAGGATGAGAAT GAAATTGAATCAATCAATCTTCCTCTTCCTCTTCCTATGTACGGTGGTCCACCGGTCTCCGCCTCCATGAACCACAACGTACAACAACACCACCACCACCTGCATCATATGGATGAAGAAGACGACGTCGTCGTTCACTGTGGTGCTAATGGTGATGAGGATGAGGATGAGGATGAGAATGACTCTTTAGTA GAAATTGAATCAATCAATCTTCCTCTTCCTCTTCCTATGTACGGTGGTCCACCGGTCTCCGCCTCCATGAACCACAACGTACAACAACACCACCACCACCTGCATCATATGGATGAAGAAGACGACGTCGTCGTTCACTGTGGTGCTAATGGTGATGAGGATGAGGATGAGGATGAGAATGACTCTTTAGTAGACAATCACAGGTACGATGTCGAGCAGGCTCCCAACTCCGATGTGGATCATCACGCGCTTTACGGCTCAGAAATGGCTCCTCCTCCTGCGCCGCCGTTAGAAGGCGGTCTAGACCAGCTCACGCTGTCGTTCCGCGGCCACGCTTATGTTTTCGACTCCGTTTCGCCCGAAAAGGTTCAGGCAGTTTTGCTACTATTGGGTGGATATGAAGTGCCCACTGCTGTTCCTACTTCTGGGACTGTTGCGCAAAACCCTAGGAATTTGAGTGATTTTCCGGNGAAGTCGAGCCTGCCGCANAGAGCTGCTTCT 5 0 5' arm Antirrhinum_majus mirnest mir-598 0.00001 100 -60.9 ......((.(((.((..((.(((((.(((((.((((.(((((.(((((.((..(((....)))....)).)))))...)))))....((.(((((......(((((((((((((((....(((...))).))))))).))))))))...))))).)))))).))))).))))).)))).))).))....... (-60.9)