mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCATGCATA GTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATGCTGAGCCCATCGAGTATCGATGACCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATAT 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-160 7e-42 aly-MIR160a 1e-40 -47.5 ((((((.(((((((..(((((((((.(((.(((..(((((.....)))))..))).))).)))))))))..))))))).)))))) (-47.50)