mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGAGGCAGCGGTTCATCGATC GAGTGAAGTCGCTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCAATTCCTGTGAATATTTATTTTTGTTTACAAAAGCAAGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTGCTTGCTC 3 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR162_2 3e-45 aly-MIR162b 8e-39 -47.8 ((((.(((((((((((.((((.((((.(((((((.((((.((((((((........)))))))).......)))).))))))).)))).)))).)))))))..)))))))) (-47.80)