mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGTACTTAACTTCTCCAAC GGGTGAGAATCTCCATGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAACCAACAAACACGAAATCCGTCTCATTTGCTTATTTGCACGTACTTAACTTCTCCAACATGAGCTCTTCACCC 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR164 2e-49 aly-MIR164a 4e-22 -48.2 ((((((..(.(((.((((((((((((..(((.(((((((((....((((.(((.....)))....))))....))))))))).)))..))))))))))))))).)..)))))) (-48.20)