mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCATCTTCACCATC GATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAGCTCATATATACACTCTCACCACAAATGCGTGTATATATGCGGAATTTTGTGATATAGATGTGTGTGTGTGTTGAGTGTGATGATATGGATGAGTTAGTTCTTCATGTGCCCATCTTCACCATC 5 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR164 7e-59 aly-MIR164b 9e-18 -65.5 (((((.((((..(((((((((....((((((((((.(((((((.((((.((((.((((((.(((((.(((((....)))))))))).))))))...)))).)))).)))....)))).))))))))))....)))))))))..)))).))))) (-65.50)