mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATCCCCC GGAATGTTGTCTGGATCGAGG GTTGAGGGGAATGTTGTCTGGATCGAGGATATTATAGATATATACATGTGTATGTTAATGATTCAAGTGATCATAGAGAGTATCCTCGGACCAGGCTTCATCCCCCCCAAC 4 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-166 3e-51 aly-MIR165a 5e-37 -48.7 ((((.((((.(((..((((((.(((((((((((...((((((((....)))))))).((((((.....))))))....))))))))))).))))))..))).)))).)))) (-48.70)