mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGATTGTTGTCTGGCTCGAGG GCGATTTAGTGTTGAGAGGATTGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAAGAGAATCACTCGAATTAATTTGGAAGAACAAATTAAGAAAACCCTAGATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCTAACCTACTTATCGC 6 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-166 3e-61 aly-MIR166c 1e-38 -46.5 (((((.(((.((((.(.(((.((..((((((..(((((((((..((..(((.....)))...((((((((......)))))))).......))..)))).)))))..))))))..)).))).).)))))))...))))) (-46.50)