mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATATTGTCTGGCTCGAGG GGTTGAGAGGAATATTGTCTGGCTCGAGGTCATGAAGAAGATCGGTAGATTGATTCATTTTAAAGAGTGAAATCCCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACC 6 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-166 3e-57 aly-MIR166d 2e-45 -41.6 (((((.(.(((((...((((((..(((((((((..((..((((....))))..(((((((....)))))))....))..)))).)))))..))))))...))))).).))))) (-41.60)