mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCACGAGG TTGAGGGGAATGTTGTCTGGCACGAGGCCCTTAACTTAGATCTATATTTGATTATATATATATGTCTCTTCTTTATTCATTAGTCTATACATGAATGATCATTTTACGGTTAATGACGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAA 4 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-166 3e-76 aly-MIR166e 7e-43 -49.3 .(((((((((((..((((((..(((.(.(.((((((.((((.(((((..........))))).)))).....((((((((((.....)).)))))))).........)))))).).).)))..))))))..))))))))))). (-49.30)