mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG GCGATTTAGGGTTTAGAGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATGGAGAGTAATTCGTTAACCCAACTCAAAACTCTAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACCTATTTTATCGC 5 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-166 1e-50 aly-MIR166g 2e-55 -47.9 (((((...(((((.((.((((((..((((((..(((((((((..(((((.....(((.....))).....)))))..)))).)))))..))))))..)))))).)).))))).....))))) (-47.90)